فيروس شيكونغونيا مسبّب داء شيكونغونيا ويندرج في جنس فيروس ألفا من الفيروسات الطحلبية؛ يُعرف اختصارًا CHIKV وينتمي إلى مجموعة فيروسات غابة سمليكي التي تضم أيضًا فيروس نهر روس وأونيونغ نيونغ وغابة سمليكي، وينتقل أساسًا عن طريق مفصليات الأرجل وخاصة البعوض، مع إمكانية انتقال عمودي أقل شيوعًا.