تطورت البنية العسكرية لحماس خلال الانتفاضة الأولى، وظهرت لاحقا كتائب عز الدين القسام بوصفها جناحها العسكري. تعود جذور هذا النشاط إلى خلايا مسلحة سبقت الإعلان الرسمي عن الاسم، ثم تكرس تنظيم القسام في مطلع التسعينيات وأصبح الذراع المسؤول عن العمليات العسكرية للحركة.