تحولت أزمة سياسية في جنوب السودان إلى قتال مسلح في جوبا في ديسمبر ٢٠١٣ بعد مقاطعة معارضين اجتماعًا حزبيًا وتصاعد الخلاف بين الرئيس "سلفا كير" ونائبه السابق "رياك مشار". سرعان ما امتد العنف إلى ولايات أخرى واتخذ أبعادًا سياسية وعرقية، لتبدأ حرب أهلية استمرت سنوات. أعلنت جمهورية جنوب السودان استقلالها رسميًا عن السودان في ٩ يوليو ٢٠١١ بعد استفتاء تقرير مصير صوّت فيه نحو ٩٩٪ من المشاركين لمصلحة الانفصال. أصبحت جوبا عاصمة الدولة الجديدة، واعترف بها المجتمع الدولي سريعًا قبل انضمامها إلى الأمم المتحدة بعد أيام من الاستقلال. وقعت حكومة السودان و"الحركة الشعبية لتحرير السودان" في نيروبي يوم ٩ يناير ٢٠٠٥ "اتفاق السلام الشامل"، منهية أكثر من عقدين من الحرب الأهلية الثانية بين الشمال والجنوب. نص الاتفاق على تقاسم السلطة والثروة وترتيبات أمنية وفترة انتقالية تنتهي باستفتاء لتقرير مصير جنوب السودان. أصبحت جنوب السودان العضو رقم ١٩٣ في "الأمم المتحدة" سنة ٢٠١١ بعد أيام من إعلان استقلالها عن السودان. أوصى مجلس الأمن بقبولها ووافقت الجمعية العامة بالإجماع. جاء الانضمام عقب استفتاء الاستقلال واتفاق السلام الشامل، ومنح الدولة الجديدة اعترافًا دوليًا واسعًا رغم التحديات السياسية والأمنية اللاحقة. أُنشئ نظام الحكم الثنائي المعروف باسم «السودان الإنجليزي المصري» سنة ١٨٩٩ بعد هزيمة الدولة المهدية وإعادة احتلال السودان بقوات مصرية وبريطانية. نصت الاتفاقية على إدارة مشتركة اسمًا بين بريطانيا ومصر، لكن النفوذ البريطاني كان الغالب عمليًا، واستمر النظام حتى استقلال السودان سنة ١٩٥٦.