الشفرة الجينية نظام القواعد الذي يربط تسلسل النيوكليوتيدات في الحمض النووي أو الحمض النووي الريبوزي بتسلسل الأحماض الأمينية في البروتين. تقرأ الخلية هذه الشفرة في مجموعات ثلاثية تعرف بالكودونات، ويقابل كل كودون حمضاً أمينياً معيناً أو إشارة توقف. تتميز الشفرة بأنها شبه عامة بين الكائنات الحية، مع وجود استثناءات محدودة، وهذا يعكس وحدة الأصل الحيوي. تمثل الشفرة الجينية الأساس الذي يحول المعلومات الوراثية إلى بنية ووظيفة، ولذلك تقع في قلب علم الأحياء الجزيئي والوراثة.