خفية الأبواغ البشرية طفيلي أولي من جماعة خفيات الأبواغ، متطفل إجباري للإنسان يستعمر القناة الهضمية مسببًا التهاب المعدة والأمعاء وإسهالًا يُعرف بداء خفيات الأبواغ؛ تُعد خفية الأبواغ البشرية وخفية الأبواغ الصغيرة من الأنواع ذات الأهمية الطبية وتنتقل عادةً عبر الماء أو الغذاء الملوثين.