أمين عام المفوضية الأوروبية هو كبير موظفي الخدمة المدنية في المفوضية الأوروبية، يتولى الإشراف على مديرياتها العامة التي يديرها مديرون عامون، ويكون مسؤولاً مباشرة أمام رئيس المفوضية الأوروبية، ويعمل على ضمان تنسيق عمل الإدارة التنفيذية للمفوضية.