تولى ميشال عون قيادة الجيش اللبناني عام 1984، ثم عُيّن عام 1988 رئيسًا لحكومة عسكرية انتقالية خلال السنوات الأخيرة من الحرب الأهلية. خاض مواجهات مع القوات السورية ومع القوات اللبنانية، وانتهت مرحلته في الحكم في أكتوبر 1990، قبل أن يغادر إلى فرنسا حيث عاش في المنفى نحو خمسة عشر عامًا.