تميّز أوميكرون بعدد كبير من التغيرات الجينية، بينها نحو 26 إلى 32 تغيرًا في بروتين الشوكة الذي يستخدمه الفيروس للارتباط بالخلايا ويستهدفه جزء مهم من المناعة. أثارت هذه الطفرات مخاوف من زيادة الانتقال أو الإفلات المناعي، لكن أثر كل طفرة لم يكن يُستنتج من عددها وحده.