تملك وكالة فرونتكس صلاحية مساعدة الدول في مراقبة الحدود الخارجية، وتنفيذ العمليات المشتركة، ومكافحة الجرائم العابرة للحدود. وتعمل الوكالة بالتعاون مع السلطات الوطنية ولا تحل محلها بصورة كاملة، فيما شملت المقترحات المرتبطة بأزمة سبتة توسيع دورها في حالات الطوارئ وتعزيز تبادل المعلومات.