ابن يونس المصري نشأ في أسرة اشتهرت بالعلم؛ فكان والده من كبار المحدثين والحفاظ، ونُسب إليه تأليف تاريخ لمصر رجع إليه العلماء. وفرت هذه البيئة لابن يونس صلة مبكرة بالمعرفة والكتابة، قبل أن يركز جهده على الفلك والرياضيات والرصد والحساب في مصر الفاطمية. ابن يونس المصري سجل رصدين لكسوف الشمس في عامي ٩٧٧ و٩٧٨ ميلادية من منطقة المقطم قرب القاهرة. وتكتسب هذه الأرصاد أهمية تاريخية لأنها تقدم مشاهدات مؤرخة يمكن مقارنتها بالحسابات الحديثة، كما تكشف دقة علماء الفلك في تسجيل الظواهر السماوية، وتفيد أيضًا في دراسة تاريخ دوران الأرض. ابن يونس المصري ارتبط بمنهج يقوم على الرصد والقياس والحساب في دراسة الظواهر السماوية، مع الاعتماد على ما يمكن التحقق منه بالمشاهدة. وتعكس أعماله توجهًا علميًا يربط بين مراقبة الكون واستخلاص النتائج منه، بدل الاكتفاء بالنقل النظري عن العلماء السابقين. ابن يونس المصري نُسبت إليه رؤية تجمع بين الاعتماد على العقل والرصد والقياس في فهم الكون، وبين التأمل الديني في الظواهر الطبيعية. وتعرض بعض المصادر هذه الرؤية في نقاط تشمل طلب الحقيقة بالمشاهدة وتدعيم الإيمان بالتأمل وممارسة المتع المشروعة في الحياة في بعض الكتابات المتأخرة عنه. تُنسب إلى ابن يونس المصري في بعض الكتابات رواية تقول إنه سبق غيره إلى فكرة بندول الساعة وربط زمن الذبذبة بطول البندول. وتبقى هذه النسبة محل نقاش تاريخي، لذلك تُذكر بوصفها رواية منسوبة إليه لا حقيقة مؤكدة، مع ثبوت مكانته الأساسية في الرصد والجداول الفلكية.