سقطت بغداد سنة ١٢٥٨ أمام جيش المغول بقيادة "هولاكو خان"، بعد حصار انتهى باقتحام المدينة وقتل الخليفة العباسي "المستعصم بالله". أنهى الحدث سلطة العباسيين في بغداد وألحق دمارًا واسعًا بالعاصمة، لكنه لم ينه وجود الأسرة العباسية التي ظهر لها خلفاء رمزيون لاحقًا في القاهرة. استولى السلطان المملوكي "الظاهر بيبرس" على "حصن الأكراد" في سوريا سنة ١٢٧١ بعد حصار خلال حملاته ضد المواقع الصليبية. كان الحصن من أقوى قلاع فرسان الإسبتارية في المشرق، واستخدم "بيبرس" رسالة مزورة لإقناع الحامية بالاستسلام، ثم أعاد المماليك تحصينه واستخدامه عسكريًا. انتهى حصار بغداد سنة ١٢٥٨ باستسلام الخليفة العباسي "المستعصم بالله" ل"هولاكو خان"، قائد الجيش المغولي وحفيد "جنكيز خان". دخل المغول المدينة وارتكبوا دمارًا وقتلًا واسعًا، وانتهى بسقوط بغداد حكم الخلافة العباسية السياسي فيها بعد أكثر من خمسة قرون، مع بقاء خلفاء عباسيين رمزيين لاحقًا في القاهرة. تولى "الظاهر بيبرس" عرش سلطنة المماليك في مصر سنة ١٢٦٠ بعد اغتيال السلطان "سيف الدين قطز" عقب الانتصار على المغول في "معركة عين جالوت". أصبح بيبرس من أبرز سلاطين المماليك، وعمل على تثبيت الدولة ومواجهة المغول والصليبيين وتعزيز الإدارة والتحصينات. وأسّس عهدًا طويل الأثر في تاريخ الدولة. غيّر شريف مكة في القرن الحادي عشر ذكر الخليفة في خطبة الجمعة من الخليفة الفاطمي الشيعي في القاهرة إلى الخليفة العباسي السني في بغداد، في خطوة حملت دلالة سياسية ودينية تتجاوز الشعائر. عكست الخطبة آنذاك الاعتراف بالسيادة الرمزية للخلافة، لذلك كان تغيير اسم الخليفة إعلانًا واضحًا لتحول الولاء السياسي.